Вы можете изменить фамилию детям на свою фамилию. Но сделать это можно только с согласия органа опеки и попечительства. Кроме того, в органе опеки должно быть и согласие отца детей.

§ Ч. 2 ст. 59 Семейного кодекса РФ

Есть случаи, когда при смене фамилии мнение отца не учитывается: если невозможно установить место нахождения отца детей; он лишен родительских прав; признан недееспособным; если отец уклоняется от воспитания и содержания ребенка без уважительных причин.

Поскольку детей отец не содержит, вам следует иметь доказательства этого факта для получения положительного решения в органе опеки и попечительства.